《關于創新體制機制推進農業綠色發展的意見》構建了新形勢下推進農業綠色發展的制度框架，對指導當前和今后一個時期農業綠色發展具有重大意義。全面推進農業綠色發展深刻革命，必須處理好發展與生態環境保護的關系，強化創新驅動和約束激勵，構建農業綠色發展的長效機制，持之以恒、久久為功。
　　要堅持以科技創新作為農業綠色發展的強大引擎。過去一個時期，農業科技成果更多服務于產量提升目標，在農業綠色發展方面的科技創新和推廣相對不足。面對農業綠色發展的新要求，農業科技進步的潛力還很大，可以形成很多新的增長點，是農業綠色發展的強大引擎。為此，要按照《意見》的要求，進一步完善各類創新主體協同攻關機制，在農業投入品減量高效利用、廢棄物資源化利用、產地環境修復等制約農業綠色發展的關鍵環節，盡快取得一批突破性科研成果。同時，加大技術集成、示范推廣和人才培訓力度，在農業生產領域加快普及一批先進適用綠色農業技術，推動綠色生產方式落地生根。
　　要努力構建標準明確、激勵有效、約束有力的綠色發展制度環境。農業綠色發展看似是資源環境問題，其實質也是經濟問題，要讓生產者和消費者自覺主動把生態環保放在重要位置去考慮，激發全社會發展綠色農業的積極性，必須依靠體制機制創新。習近平總書記多次強調，只有實行最嚴格的制度，最嚴密的法治，才能為生態文明建設提供可靠保障。因此，要以貫徹落實《意見》為契機，構建起有利于農業綠色發展的制度體系：一是完善政策激勵。以耕地保護補償、生態補償制度和綠色金融激勵機制等為重點，加快建立分類科學、區域有別、標準合理、規范統一的農業綠色發展激勵政策體系，引導和激勵生產者加快轉變發展方式。二是加強標準引領。加快建立健全綠色農業標準體系，完善農業投入品、廢棄物排放和農產品質量安全等領域的相關標準和行業規范，引導市場主體按綠色標準進行生產經營。三是強化制度約束。著力完善綠色農業法律法規體系，加大執法和監督力度，依法打擊破壞農業資源環境違法行為，提高違法成本和懲罰標準，用法律法規為市場主體劃定行為邊界。要把《意見》作出的一系列制度安排落到實處，依靠“疏堵結合”的制度環境，有力地引導和推動社會各方共同參與到農業綠色發展的機制中來。
　　要把建立監測評價體系作為推進農業綠色發展的基礎支撐。長期以來，我國農業資源環境生態系統數據基礎薄弱，評估測算體系不健全，農業資源和生態環境的價值難以體現并得到有效保護。這次《意見》明確提出建立農業資源環境生態監測預警體系，構建充分體現資源稀缺和損耗程度的生產成本核算機制，建設“天空地”數字農業管理系統。這一套體系的建立，既有利于發揮市場機制作用為農業綠色發展定價，從而驅動綠色產業、發展綠色經濟；也有助于強化資源環境考核評價，落實各級政府和部門的綠色發展責任，將為農業綠色發展提供重要的基礎支撐。